合同被涂改后的处理方式主要取决于涂改是否经过双方协商一致。以下是具体的处理步骤和原则：双方协商一致如果合同的涂改是经过双方当事人协商一致，并且对涂改内容有明确的书面约定，则涂改部分有效，双方应按照涂改后的内容履行合同。单方擅自涂改如果合同的涂改是单方擅自进行的，则涂改部分无效，依然按照原合同内容履行